En vertu d'un protocole, Fuga comprend toutes les actions pouvant être effectuées par un vétérinaire par lesquelles une ou plusieurs actes sont combinées à l'utilisation d'excipients (produits). Exemples de protocoles: castration d'un mâle, césarienne d'un bovin, etc. Ce protocole peut ensuite être appliqué en consultation. L'avantage de l'utilisation des protocoles dans une consultation est qu'il n'est pas nécessaire de réenregistrer tous les excipients utilisés et les actes appliquées à chaque fois, car cela se produit automatiquement. Lorsque le protocole est ajouté, les produits sont retirés du stock.